La perte de population a transformé la société européenne, mettant fin au système féodal, établissant des salaires pour les anciens serfs et élevant le statut des femmes dans la mesure où de nombreuses mères, épouses et filles ont survécu aux hommes de la famille et ont assumé leurs rôles. Pour de nombreux historiens, la Peste Noire a marqué la fin du Moyen-Âge. La désillusion des gens à l'égard des paradigmes religieux, politiques et médicaux du passé les a incités à rechercher des alternatives, et celles-ci finiraient par trouver leur pleine expression dans la Renaissance qui jette les bases du monde de l'ère moderne.
Les mesures les plus anciennes d'isolement des pestiférés consistaient à enfermer les pestiférés (et leur famille) dans leur maison (séquestration), une autre est l'expulsion hors de la ville.
La propagation de la maladie impose aux Etats des décisions qui s’inscrivent dans la protection des populations par des mesures d’hygiène. Des hôpitaux spécialisés dans la prise en charge des contaminés ont été créés.
Suite à la peste, les maisons populaires sont conçues autrement. Subdivision des espaces pour séparer les paysans des animaux, tapis, latrines et construction des maison en pierre plutôt qu’en bois pour lutter contre la propagation des rongeurs.
L'Église organise des processions religieuses ou des actes de dévotion pour apaiser la colère divine, par exemple la confection de cierges géants, la procession à pieds nus, les messes multiples simultanées ou répétées.
Faute de comprendre les causes du mal, les sociétés médiévales désignaient les « semeurs de pestes », juifs, étrangers ou marginaux. Une logique de stigmatisation qui a disparu aujourd’hui, hormis quelques attitudes de rejet.
En 1340, les autopsies publiques des pestiférés sont autorisées afin d'étudier les corps. Cette mesure marque le début des dissections à but médical. Guy de Chauliac participe à des dissections de cadavres qui l'éclairent sur le corps de l'homme.
Lorsque la vie reprend son court après la grande peste, paysans et manœuvriers profitent de la raréfaction de la main d’œuvre pour demander aux seigneurs des libertés nouvelles, la plus célèbre étant la Grande Jacquerie en 1358.
La Peste est à l’origine de la première guerre bactériologique lorsque les Tartares catapultent des cadavres pestilentiels sur la colonie génoise en 1346.